在macOS Sierra 10.12.1上安装rJava:链接器错误licuuc

我试图在R-Studio中安装rJava但错误

ld: library not found for -licuuc clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation) make[2]: *** [libjri.jnilib] Error 1 make[1]: *** [src/JRI.jar] Error 2 make: *** [jri] Error 2 ERROR: compilation failed for package 'rJava' * removing '/Users/iMacLinda/Library/R/3.3/library/rJava' Warning in install.packages : installation of package 'rJava' had non-zero exit status 

[R

version _ platform x86_64-apple-darwin16.1.0 arch x86_64 os darwin16.1.0 system x86_64,darwin16.1.0 status major 3 minor 3.2 year 2016 month 10 month 31 svn rev 71607 language R version.string R version 3.3.2(2016-10) -31)昵称真诚的南瓜补丁

如何修复此链接器错误?

我在MacPorts的其他地方找到了解决方案, 这里引导的步骤1-5和此处引导的步骤6。

  1. 以root(sudo bash)编辑/opt/local/Library/Frameworks/R.framework/Resources/etc/Makeconf并将行LIBS = -llzma -lm -liconv -licuuc -licui18nLIBS = -llzma -lm -liconv

  2. 安装原始的1.6 Mac Java

  3. run export JAVA_HOME=/System/Library/Java/JavaVirtualMachines/1.6.0.jdk/Contents/Home

  4. R CMD javareconf

  5. 现在你可以启动R并执行install.packages("rJava")

  6. sudo ln -f -s $(/usr/libexec/java_home)/jre/lib/server/libjvm.dylib /usr/local/lib

这里有Anaconda的解决方案。 问题在于路径变量,所以也许这也可以解决问题。 我概述了下面的解决方案,关于如何在这里解决它。


清理你的道路

  1. 检查配置设置

     R CMD config --ldflags -L/Users/osx/anaconda3/lib/R/lib -lR -lpcre -llzma -lbz2 -lz -lm -liconv -licuuc -licui18n 
  2. 测试这个mv ~/.bash_profile ~/.bash_profile_backup

  3. 重启终端。

  4. 现在R中的环境变量应该是不同的

     $ R CMD config --ldflags -F/Library/Frameworks/R.framework/.. -framework R -lpcre -llzma -lbz2 -lz -licucore -lm -liconv 
  5. 运行以下

     sudo R CMD javareconf Rscript -e 'install.packages("rJava", repos="http://rforge.net", type="source")' 
  6. 如果你能够安装rJava,问题出在你的路径上,否则尝试替代解决方案。

Homebrew的替代解决方案

Homebrew还有一个解决方案,其中R安装了brew cask install r-app并且必须在没有forenmp标志的情况下重新编译gcc。