从R调用时,h2o无法连接:Java版本不匹配
h2o
之前在我的笔记本电脑上工作,但我暂时没有使用它(并且在此期间安装了新软件包和更新的东西)。 昨天我尝试使用它,但它没有用。 我删除了包装的R
h2o
,我从头开始重新安装了h2o
install.packages("h2o")
我尝试用h2o.init()
运行h2o
,但它给了我这个错误
java version "9" Java(TM) SE Runtime Environment (build 9+181) Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 9+181, mixed mode) Starting H2O JVM and connecting: ............................................................ [1] "localhost" [1] 54321 [1] TRUE [1] -1 [1] "Failed to connect to localhost port 54321: Connection refused" % Total % Received % Xferd Average Speed Time Time Time Current Dload Upload Total Spent Left Speed 0 0 0 0 0 0 0 0 --:--:-- --:--:-- --:--:-- 0curl: (7) Failed to connect to localhost port 54321: Connection refused [1] 7 Error in h2o.init() : H2O failed to start, stopping execution.
当我查看它显示的错误日志时
Only Java 1.6-1.8 supported, version is 9
我试图寻找更多信息,我认为错误是由第1836行的代码触发的:
if (version != null && !(version.startsWith("1.6") || version.startsWith("1.7") || version.startsWith("1.8"))) { System.err.println("Only Java 1.6-1.8 supported, version is " + version); return true;
所以似乎h2o
正在检查以1.6,1.7和1.8开头的版本,但我的版本出于某种原因从9开始! 但是,在终端上, java -version
给出了
openjdk version "1.8.0_121" OpenJDK Runtime Environment (Zulu 8.20.0.5-macosx) (build 1.8.0_121-b15) OpenJDK 64-Bit Server VM (Zulu 8.20.0.5-macosx) (build 25.121-b15, mixed mode)
以及which java
给出的
/Users/myusername/anaconda3/bin/java
————编辑——-
更多信息: /usr/libexec/java_home -V
给出
Matching Java Virtual Machines (4): 9, x86_64: "Java SE 9" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-9.jdk/Contents/Home 1.8.0_144, x86_64: "Java SE 8" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_144.jdk/Contents/Home 1.8.0_51, x86_64: "Java SE 8" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_51.jdk/Contents/Home 1.8.0_25, x86_64: "Java SE 8" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_25.jdk/Contents/Home
这解释了h2o
所看到的9
。 我觉得奇怪的是它期望1.x.0
但版本只有9
。 在任何情况下,似乎我需要将h2o.init()
命令指向1.8
java,但我无法弄清楚如何做到这一点。
我通常使用brew
安装大多数东西,但我从不使用java
所以我对这些版本一无所知。
谢谢,最好!
您报告的错误说:
仅支持Java 1.6-1.8,版本为9
好像你安装了Java 9,H2O尚不支持。 使用兼容的Java版本,将修复错误。
如果您不能或不想卸载Java 9,那么您需要通过设置JAVA_HOME
环境变量告诉H2O您要使用哪个Java。 首先,通过在shell中执行以下命令来获取Java 1.8的位置:
/usr/libexec/java_home -v 1.8
在我的Mac上,它告诉我这个:
/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_45.jdk/Contents/Home
您可以通过运行以下命令来检查R是否可以看到您的JAVA_HOME
变量: Sys.getenv("JAVA_HOME")
。
如果那是空白的(如果你使用的是RStudio,可能就是这样),那么就必须做更多的工作才能让R看到JAVA_HOME
变量。 您可以编辑~/.Renviron
文件以添加JAVA_HOME=/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_45.jdk/Contents/Home
或您机器上的任何位置。 然后重启RStudio它应该工作。
我按照这个post中的讨论来解决问题,尽管对某些人来说这不方便。
默认的java
是1.8.x,因此一旦h2o
可以使用,但是从R
调用h2o
导致调用版本9的java
。
现在的(相当零散的)解决方案是从终端启动h2o
服务器,就像这样
cd h2o-3.14.0.3 #navigate to wherever you have the h2o installation java -jar h2o.jar
运行正常,然后我从R
链接它而不启动h2o
实例:
h2o.init(startH2O = FALSE)
如果您可以从终端启动h2o
(如果您正在处理群集可能是唯一的方法),这可以正常工作,但如果您想立即从RStudio
启动它可能会很烦人。